코딩 AI를실험실 조교로,과학 스킬177개
중급자용© AIKOREACLUBK-Dense-AI/scientific-agent-skills
코딩 AI를 실험실 조교로, 과학 스킬 177개
논문 검색, 문헌 조사, 인용 검증, 유전체·화학·임상 데이터 분석 같은 연구 절차를 코딩 AI에 지침으로 넣어 주는 스킬 모음이에요. 클로드 코드·커서·코덱스 등 Agent Skills 표준을 따르는 도구에서 써요
대학원생이 클로드 코드에 "PubMed에서 최근 논문 찾아서 정리해 줘"라고 해 봐요. 그럴듯한 목록이 나오는데, 있지도 않은 DOI가 섞여 있고 어느 데이터베이스를 어떻게 뒤졌는지는 남지 않아요. 코딩 AI는 코드를 잘 쓰지만, 과학자가 몸으로 익힌 절차는 모르거든요.Scientific Agent Skills는 그 절차를 글로 적어 둔 스킬 177개예요. 학술 API 18개를 어떻게 부르고 어디서 조용히 실패하는지, 문헌 조사를 어떤 일곱 단계로 하는지, 논문의 모든 주장에 근거를 어떻게 묶는지 같은 것들이죠. 생물·화학·의학·물리·공학·지구과학·데이터 분석까지 걸쳐 있고, 깃허브 별 5만 6천 개에 arXiv 논문으로도 정리돼 있어요.
같은 부탁, 스킬이 있고 없고의 차이
스킬 없이 코딩 AI만
그럴듯한 목록이 빨리 나오지만, 어디서 어떻게 찾았는지 남지 않고 없는 논문이 섞여도 알 길이 없어요.
paper-lookup 스킬을 켜면
어느 데이터베이스를 어떤 조건으로 불렀는지 기록이 남고, 비어 있으면 비어 있다고 말해요. 그래도 원문 확인은 사람 몫이에요.
스킬 문서가 적어 둔 절차(용도에 맞는 데이터베이스 고르기, 응답 모양 의심하기, 출처 기록)를 두 칸에 나란히 놓았어요.

paper-lookup 스킬 문서의 절차와 출력 형식을 보여 주려고 저희가 그린 예시예요. 논문 제목·DOI·건수는 지어낸 것이고, 왼쪽 칸의 실패 모양은 코딩 AI와 모델마다 달라요.
한눈에
무엇인가요
Agent Skills 표준을 따르는 스킬(SKILL.md 문서 하나와 참고 자료·스크립트)을 177개 모아 둔 저장소예요. 코딩 AI가 관련 일을 할 때 이 문서를 꺼내 읽고 그대로 따라요.무엇이 들어 있나. 데이터베이스 조회 스킬 하나가 PubChem·ChEMBL·UniProt·ClinicalTrials.gov 같은 데이터베이스 80곳을 다루고, RDKit·Scanpy·scikit-learn 같은 파이썬 패키지용 스킬이 70개 넘어요. Benchling·Opentrons 같은 실험실 플랫폼 연동 9개, 문헌 조사·과학 글쓰기·동료 평가·포스터·슬라이드 같은 분석·소통 도구 30개 넘게, 가설 세우기·연구비 신청서 같은 연구 방법 스킬도 있어요.어디서 쓰나. 클로드 코드, 커서, 코덱스, 제미나이 CLI, 구글 안티그래비티 등 Agent Skills 표준을 따르는 도구예요. 같은 회사가 이 스킬을 넣은 무료 데스크톱 앱(K-Dense BYOK)도 따로 공개했어요.원래 이름. Claude Scientific Skills였다가 클로드 말고 다른 에이전트에서도 쓰이도록 이름을 바꿨어요. 2.72.0판부터는 앤트로픽 저장소에서 가져왔던 워드·PDF·파워포인트·엑셀 스킬 네 개를 뺐어요.스킬은 모델을 더 똑똑하게 만드는 게 아니에요. 어떤 데이터베이스를 어떤 순서로 부르고, 결과를 어떻게 의심하고, 무엇을 기록으로 남길지 적어 둔 손버릇 문서예요.
함께 쓰는 도구 · 클로드 코드 · 커서 · 코덱스 · 제미나이 CLI · 구글 안티그래비티 · Agent Skills 표준을 따르는 다른 도구
이런 분께
- 논문 검색과 문헌 정리에 코딩 AI를 쓰고 싶은데 지어낸 인용이 걱정되는 대학원생·연구자
- 유전체·화학·임상·영상 데이터를 파이썬으로 다루는 연구실에서 분석 절차를 통일하고 싶은 분
- 연구 보고서·학회 포스터·슬라이드를 근거 표시와 함께 만들어야 하는 분
어떻게 작동하나요
1. 설치하면 SKILL.md가 에이전트 손에 들어가요. 스킬마다 SKILL.md에 목적·절차·버전이 적혀 있고, 필요하면 참고 문서와 스크립트가 딸려요. 에이전트가 관련 일을 만나면 이 문서를 읽고 따르고, 프롬프트에서 스킬 이름을 불러 직접 켤 수도 있어요.2. 예를 들어 논문 찾기는 이렇게 가요. paper-lookup 스킬은 먼저 무엇을 찾는지(DOI 하나인지, 주제인지, 인용 그래프인지) 정하고, 그 용도에 맞는 데이터베이스 한두 곳만 골라요. 그다음 그 데이터베이스의 참고 문서를 읽는데, 거기에 '응답이 200이어도 실패일 수 있는' 함정이 적혀 있어요. 호출은 범위를 정해서 하고, 답은 어떤 주소와 조건으로 찾았는지 다시 돌릴 수 있게 기록해요.3. 문헌 조사는 일곱 단계예요. 계획과 범위 → 데이터베이스 검색(검색어와 날짜 기록) → 제목·초록·본문 순 선별 → 자료 추출과 질 평가 → 주제별 종합 → 인용 검증 → 문서 생성. 인용 검증은 스크립트로 DOI 등록을 확인한 뒤 실제 원문과 대조해요.4. 글쓰기는 근거 ID로 묶여요. scientific-writing 스킬은 사실이나 숫자를 담은 문장마다 [claim:C001] [evidence:E001] 같은 꼬리표를 붙이고, 사람이 출처를 열어 확인하고 누가 언제 확인했는지 적기 전엔 검증된 것으로 치지 않아요.스킬 문서 자체가 '사람이 원문을 열어 확인하기 전엔 검증된 게 아니다'라고 못 박아요. 이 도구를 쓰더라도 논문 인용은 직접 열어 확인하는 게 전제예요.
바로 쓸 수 있나요
필요한 것클로드 코드·커서·코덱스·제미나이 CLI 같은 Agent Skills 지원 도구, 파이썬 3.13 이상(저장소 도구 기준)과 uv, 맥·리눅스 또는 윈도우 WSL2. 스킬마다 패키지·API 키·네트워크가 따로 필요해요
비용저장소는 무료(MIT)지만 스킬마다 라이선스가 달라요. 쓰는 코딩 에이전트 요금과 일부 유료 데이터베이스·클라우드 서비스 비용은 따로예요
시작하기
- 한 줄 설치(클로드 코드·코덱스·제미나이 CLI·커서 등)
Agent Skills 표준 설치 도구예요. 어디에 설치되는지는 쓰는 도구의 문서에서 확인하라고 README가 적어요.
npx skills add K-Dense-AI/scientific-agent-skills - 스킬 하나만 골라 설치(깃허브 CLI 2.90 이상)
README가 전부 설치하지 말고 필요한 것만 넣으라고 권해요. 예: 논문 찾기 스킬만.
gh skill install K-Dense-AI/scientific-agent-skills paper-lookup - uv 설치(맥·리눅스)
스킬이 파이썬 패키지를 설치할 때 쓰는 도구예요. 윈도우는 WSL2 안에서 써요.
curl -LsSf https://astral.sh/uv/install.sh | sh - 스킬 문서 읽고 의존 패키지 넣기
각 스킬의 SKILL.md에 필요한 패키지·API 키·네트워크가 적혀 있어요. 스킬 파일을 넣어도 패키지는 자동으로 깔리지 않아요.
- 에이전트에 부탁하기
README 예시는 모두 이 한 줄로 시작해요. 그 뒤에 할 일을 적어요.
Use available skills you have access to whenever possible. ...
find papers on CRISPR and get me the PDFs
paper-lookup 스킬 문서에 나오는 요청 예시예요. 한국어로 부탁해도 되는지는 README에 적혀 있지 않고, 한국어 지원에 관한 언급도 없어요. 스킬 문서와 예시 프롬프트는 모두 영어예요.처음 쓰는 순서
필요한 스킬만 고르기README가 전부 설치하지 말고 쓸 것만 넣으라고 권해요SKILL.md 먼저 읽기무엇을 하고, 어떤 패키지와 외부 서비스를 쓰는지 확인설치npx skills add 또는 gh skill install <저장소> <스킬이름>의존 패키지 따로 설치스킬 파일을 넣어도 패키지는 안 깔려요. uv 로 스킬별 환경을 나눠요프롬프트 앞에 한 줄README 예시처럼 'Use available skills you have access to whenever possible' 로 시작
README의 시작하기·보안 안내·예시 프롬프트를 처음 쓰는 순서로 묶은 예예요.
스킬 하나를 켜면 에이전트가 이렇게 움직여요
README의 설치 명령과 각 스킬 문서(paper-lookup, literature-review, scientific-writing, database-lookup)에 적힌 절차를 따라 저희가 그린 예시예요. 논문 제목·수치·확인 날짜는 지어낸 것이고, 실제 진행은 쓰는 코딩 AI와 모델에 따라 달라요.
명령어 전체 14개, 언제 쓰나
문헌·글쓰기 스킬
paper-lookup- 학술 API 18개 검색, DOI·PMID 조회, 열린 접근 PDF 찾기, 인용 그래프
literature-review- 체계적·범위·서술 문헌 조사 일곱 단계, PRISMA 흐름도
scientific-writing- 근거 ID가 붙은 원고 작성·수정·점검
citation-management- 인용 형식과 참고문헌 관리, pyzotero 연동
peer-review- 허가받은 원고의 비공개 동료 평가
데이터·분석 스킬
database-lookup- 데이터베이스 80곳을 한 스킬로. 페이지 넘김과 출처 기록 포함
scanpy- 단일세포 RNA 분석
rdkit- 분자 구조 다루기와 물성 계산
statistical-analysis- 통계 검정과 실험 설계
scientific-visualization- 논문용 그림
발표·소통 스킬
scientific-slides- 파워포인트 발표 자료
latex-posters- LaTeX 학회 포스터
scientific-schematics- 개념 도식
infographics- 인포그래픽 10종, 색약 대응 색
README 분류에서 연구실 밖에서도 쓸 만한 것을 골랐어요. 전체 177개 목록은 docs/skills.md, 과학자용 안내서는 docs/skill-guides 에 있어요. 스킬은 프롬프트에서 이름을 부르면 켜져요.
코딩 도구 없이도 써요
같은 회사가 공개한 무료 오픈소스 앱이에요. 내 API 키를 넣고 모델 40여 개 중 골라 쓰며, 이 스킬 177개와 데이터베이스 100곳 넘게가 들어 있고 자료는 내 컴퓨터에 남는다고 README가 적어요.
열기 ↗비슷한 도구
이 저장소는 코딩 AI에 연구 절차를 가르치는 쪽이고, GPT Researcher는 보고서를 바로 써 주는 쪽, AnythingLLM은 내 문서 안에서 답하는 쪽이에요(각 README 기준).
주의할 점
- AI가 찾은 논문과 출처는 반드시 원문을 열어 확인하세요. 스킬 문서도 'DOI가 등록돼 있다는 것이 그 주장을 뒷받침한다는 뜻은 아니다', '사람이 열어 확인하기 전엔 검증된 게 아니다'라고 적어요.
- 스킬은 코드를 실행하고 패키지를 깔고 네트워크에 접속하고 파일을 고칠 수 있어요. README의 보안 안내는 필요한 것만 설치하고, 설치 전에 SKILL.md를 읽고, 공개된 보안 점검 결과(docs/security-report.md)를 보라고 해요. 커뮤니티가 보탠 스킬은 회사가 만든 것만큼 꼼꼼히 보지 못했을 수 있다고도 밝혀요.
- 저장소는 MIT지만 스킬마다 SKILL.md의 license 칸에 다른 라이선스가 적혀 있을 수 있어요. 상업적으로 쓰기 전에 쓰는 스킬의 라이선스를 하나씩 확인하라고 README가 거듭 적어요.
- 임상·규제 스킬은 진단, 치료, 임상시험 적격 판단, 인증·승인 결정을 하지 않아요. README는 이런 스킬의 결과를 '자격 있는 전문가의 검토를 위한 초안'으로만 두라고 해요.
- 스킬 파일을 넣어도 파이썬 패키지는 따로 깔아야 하고, 스킬끼리 파이썬 버전이나 패키지 버전이 충돌할 수 있어 환경을 나누라고 해요. 데이터베이스 조회는 속도 제한과 API 키가 걸릴 수 있어요.
더 보기
미국 회사 K-Dense Inc.(k-dense.ai)가 만들고 관리해요. README가 안내하는 논문 'Scientific Agent Skills: A Library of Procedural Knowledge for Research Agents'(arXiv:2609.00065, Kassis 외, 2026)는 arXiv에 같은 제목과 저자로 올라 있는 것을 확인했어요(2026-11-03).
과학자용 스킬 안내서 ↗전체 스킬 목록 ↗활용 예시 모음 ↗보안 점검 결과 ↗논문(arXiv:2609.00065) ↗깃허브 저장소 ↗
낯선 말
- 에이전트 스킬 · 코딩 AI가 특정 일을 할 때 꺼내 읽는 지침 묶음. SKILL.md 문서가 중심이에요
- Agent Skills 표준 · 여러 코딩 도구가 같은 스킬 폴더를 읽을 수 있게 정한 공개 규격이에요
- DOI · 논문마다 붙는 고유 번호. 10.으로 시작하고 링크로 바꿀 수 있어요
- PubMed·arXiv·OpenAlex · 각각 의학, 물리·수학·컴퓨터 과학 사전 출판, 전 분야 논문을 모은 데이터베이스예요
- uv · 파이썬 패키지를 빠르게 설치하고 환경을 나누는 도구예요
- PRISMA · 체계적 문헌 조사에서 검색·선별 과정을 적는 표준 흐름도예요
- 재현 가능 · 같은 검색어와 조건으로 다른 사람이 다시 돌려도 같은 결과가 나오게 기록해 두는 것이에요
댓글
AI 답은 참고 자료예요. 법·세금·돈·건강처럼 삶에 큰 영향을 주는 일에서는 AI 답이 정답이 될 수 없어요. 최종 판단은 전문가나 공식 기관에서 확인하세요.

